Remake de la tercera entrega de la subsaga RPG 'Mario & Luigi', estrenada originalmente publicada en Nintendo DS que contaba las desventuras de los dos hermanos fontaneros cuando son tragados por su archienemigo, con quien tendrán que aliarse para derrotar a un enemigo que planea hacerse con el control del Reino Champiñón y cumplir su venganza milenaria sobre sus mortales rivales.
Además de la trama original y gráficos renovados, 'Mario & Luigi: Viaje al centro de Bowser + Las peripecias de Bowsy' nos aporta la historia de Bowsy, el hijo de Bowser quien vive sus propias aventuras mientras su padre lucha por controlar el Reino Champiñón. Tendremos que juntar nuestras fuerzas con el resto de los hermanos adoptivos, quienes desean también la pronta recuperación de la tiránica tortuga escupe fuego y que la princesa Peach acabe bajo nuestras garras para por fin recibir el preciado aprobado de nuestra inexistente figura paternal.