Lejos de acabar el desarrollo de
Syphon Filter: The Omega Strain,
Sony ya se ha visto envuelta en el primer escándalo protagonizado por el juego, y que ha obligado a la compañía a cambiar parte del argumento del mismo. Nos situamos en Toronto, Canadá. Un grupo terrorista ha tomado el control del metro de la ciudad y aterroriza a los ciudadanos. Nuestra misión es acceder al subterráneo, acabar con todos los paramilitares y retomar el control de los trenes. Es el argumento de la misión que ha causado polémica en Canadá.
El parlamento de ese país ha amenazado a
Sony con prohibir la venta del juego en todo su territorio ya que éste ofrece una visión errónea de los canadienses, y por la similitud del inventado grupo terrorista del juego con el Frente de Liberación de Quebec (FLQ), responsables en 1970 del asesinato de un ministro de Canadá.
Para atajar las críticas,
Sony ha confirmado que eliminará dicha misión de la versión final del juego y evitará cualquier mención a Canadá. Asimismo, la compañía ha anunciado que mantiene el lanzamiento de
Syphon Filter: The Omega Strain en Enero de 2004.